Merjenje telesne temperature je velikega zdravstvenega pomena. Razlog je v tem, da številne bolezni spremljajo značilne spremembe telesne temperature. Prav tako lahko potek nekaterih bolezni spremljamo z merjenjem telesne temperature, zdravnik pa lahko oceni učinkovitost zdravljenja. Vročina je najpogostejša oblika patološkega (z boleznijo povezane) povišanja telesne temperature. 

V bistvu je res, da je izmerjena telesna temperatura vedno odvisna od tega, kje je izmerjena. Zato v nasprotju s splošnim prepričanjem ni "normalne temperature". Poleg tega se telesna temperatura zdrave osebe spreminja glede na aktivnost in čas dneva. Pri merjenju rektalne temperature je večerna temperatura kar za 0,5 °C višja, zaradi fizioloških razlogov. Telesna temperatura je običajno povišana po telesni aktivnosti. 

Grobo rečeno, ločimo med temperaturo jedra in površine, kjer se površinska temperatura meri na površini kože in je mešanica temperature jedra in temperature okolice. Temperatura jedra se meri z vstavitvijo termometra v telesno votlino, ki določa temperaturo sluznice. 

V bistvu je treba razlikovati med tehnično točnostjo samega termometra in klinično točnostjo pri merjenju temperature. Prva se določi pod idealiziranimi pogoji, da se zagotovi kakovost instrumenta ob upoštevanju tehničnih standardov.  Točnost od + 0.1°C lahko štejemo za najnovejši dosežek pri visokokakovostnih termometrih. 

Uporabnik NE SME zamenjati tehnične točnosti s točnostjo pri uporabi. Že opisane temperature človeškega telesa, so odvisne od mesta in časa merjenja, so posledica fizioloških vzrokov in ne okvare termometra. S pravilno uporabo termometra lahko točnost močno povečate (preberite navodila za uporabo!)

Najbolj zanesljivo temperaturo jedra dobimo z vstavitvijo termometra v rektum (rektalno merjenje). Ta meritev je točna in ima nizko razpršenost rezultatov.  Normalno območje je približno 36,6 °C do 38 °C.

Oralno merjenje je lahko bukalno (v licu) ali sublingvalno (pod jezikom). Obe meritvi odstopata od rektalno izmerjene temperature za približno  0,3 °C do 0,8 °C.

Edini vrsti merjenja telesne temperature, ki se klinično uporabljata v praksi, sta merjenje pod pazduho (aksilarno merjenje) in merjenje v dimljah (ingvinalno merjenje). V obeh primerih pritisnemo ustrezen ud ob telo, da zmanjšamo vpliv temperature okolice. Vendar, je to uspešno le v omejenem obsegu. Pomanjkljivost je, da je čas merjenja dolg. Pri odraslih je aksilarna meritev nižje od rektalne za približno 0,5 °C do 1,5 °C!

Pri dojenčkih je razlika med aksilarnim in rektalnimi meritvami veliko manjša.

Infrardeči ušesi termometri merijo infrardečo energijo, ki jo oddaja bobnič in okoliško tkivo. Brezkontaktni termometer meri infrordečo energijo, ki jo oddaja čelo. Ta energija se zbira skozi lečo in pretvori v pravilno vrednost temperature.